Comment mettre en forme des formules chimiques?

N'utilisez pas les équations mathématiques pour écrire les formules chimiques! Cela donnerait des choses commes $H_2O$ ou $CH_3$, en italiques, alors que les formules chimiques ne sont pas censées l'être…

En dépannage, il est encore mieux de bricoler quelque chose qui apparaîtra en romains, par exemple comme ça: 

La combustion de CH$_4$ donne H$_2$O et CO$_2$.

La combustion de CH$_4$ donne H$_2$O et CO$_2$.

(Mais il reste beaucoup plus propre d'utiliser un package adapté. Lisez ci-dessous.)

Il existe des packages pour écrire

$\Reponse$ Le package chemfig permet de représenter des structures chimiques à l'aide de TikZ. Il est maintenu et semble le plus utilisé.

$\Reponse$ Les packages chemmacros et chemformula permettent notamment d'écrire des réactions chimiques.

$\Reponse$ Le package ppchtex permet d'écrire des formules chimiques. L'exemple ci-dessous présente son utilisation avec \LaTeX et babel:

Il y a une incompatibilité avec le package babel ou le shareware French Pro, due au fait que ces packages rendent actifs les deux-points. Il faut alors utiliser la commande \nonfrench de French Pro ou la commande \selectlanguage de babel qui aura alors été appelé avec les deux options de package francais et english.
\documentclass[twocolumn]{article} \usepackage{etex} \usepackage[T1]{fontenc} \usepackage[latin1]{inputenc} \usepackage[a4paper,margin=2.5cm]{geometry} \usepackage{m-pictex,m-ch-en} \usepackage[english,francais]{babel} \begin{document} Voici quelques exemples de ce que peut faire \texttt{ppchtex} (repris de la page de Manuel Luque). Attention~: lorsqu'on utilise \texttt{babel}, il faut sortir du mode français avant de saisir les formules chimiques. \selectlanguage{english} \startchemical[scale=big,% size=big,% width=fit,% height=fit] \bottext{Dioxyde de carbone} \chemical[ONE,Z0,DB15,SAVE,DIR1,3OFF1,Z0,EP28, RESTORE,DIR5,DIR5,2OFF1,Z0,EP46]% [C,O,O] \stopchemical \selectlanguage{french} Et on revient en mode français après l'équation. \selectlanguage{english} \begingroup \setupchemical[size=big,scale=big,width=fit] \startchemical[height=fit,bottom=6000] \chemical[ONE,DB1,Z01,SB3,MOV3,Z015,BB15,SB3, MOV3,Z015,BB15,SB3,MOV3,Z015,BB15,SB3, MOV3,Z0135,BB15,SB3] [HC,O,C,OH,H,C,H,HO,C,OH,H,C,OH,CH_2OH,H] \bottext{\textit{Représentation de Cram}} \stopchemical \startchemical[height=fit,bottom=3000] \chemical[SIX,B123,B56,ER5,RB1,RD236,R4,RZ123456, Z123456]% [OH,OH,OH,OH,O,OH,\TL{3 }{}, \R{\hphantom{22} 4}{},% \T{5}{},\T{6}{},\BR{1}{},\B{2}{}] \bottext{\textit{Représentation du D-glucose}} \stopchemical \endgroup \begingroup \setupchemical[size=big,scale=big] \startchemical[height=4500,bottom=1500] \chemical[SIX,ROT4,B,C,R12,RBN] \chemical[PB:RZ1,ONE,Z0,SB5,MOV5,Z04,CZ6,SB4,% DB6,PE] [O,C,H_3C,O] \chemical[PB:RZ2,ONE,Z0,CZ6,SB1,DB6,MOV1,Z0,% SB2,DIR2,Z0,SB1,MOV1,3OFF1,Z0,5OFF1,% SB1,MOV1,Z07,SB17,MOV1,Z02,CZ8,SB2,% DB8,PE]% [C,O,O,NH,(CH_2)_4,CH,NH_2,C,OH,O] \bottext{\textit{Acétylsalicylate de lysine}} \stopchemical \endgroup \startchemical[scale=big,size=big,% width=fit,height=8000] \bottext{4-éthyl-2,5-diméthylhexane} % Commençons par le carbone 7 \chemical[ONE,Z0,SB1] [\TL{7}{CH_3}] % poursuivons avec le C6 \chemical[MOV1,Z0,SB1] [\TL{6}{CH_2}] % puis C5 et sa ramification \chemical[MOV1,Z03,SB13] [\TL{5}{CH},CH_3] %puis C4 \chemical[MOV1,Z0,SB3] [\TL{4}{CH}] % puis la ramification vers C3... % SAVE pour sauvegarder la position initiale % avant de ramifier \chemical[SAVE,MOV3,Z0] [\TL{3}{CH_2}] \chemical[SAVE,MOV3,Z013,SB137] [\TL{2}{CH},\TL{1}{CH_3},CH_3] % on termine avec les deux derniers atomes % de carbone après être revenu au carbone 4 \chemical[RESTORE,RESTORE,MOV1,Z01,SB15] [CH_2,CH_3] \stopchemical \selectlanguage{french} Suite du texte en français. \end{document}

$\Reponse$ Le package mcf2graph utilise le Molecular Coding Format pour décrire les structures chimiques de façon très compacte, puis les dessiner.

$\Reponse$ Les utilisateurs de Windows peuvent utiliser MDL Isis Draw qui est gratuit pour toute utilisation personnelle ou académique. Ce logiciel permet de créer ses propres structures et de les sauver au format EPS. Il est disponible à: http://www.mdli.com/downloads/downloadable/index.jsp.

$\Reponse$ Les utilisateurs de Linux peuvent jeter un coup d'œil à http://www.randomfactory.com/lfc/lfc.html.

$\Reponse$ Il existe le package chemsym.

$\Reponse$ Le package XyMTeX permet de définir des structures chimiques.

Commentaire de F. Jacquet:
  • XyMTeX est incompatible avec le shareware French Pro de Bernard Gaulle. Pour utiliser les deux dans un même document, il suffit de repasser en mode english avant la macros puis french après. Je ne sais pas comment cela fonctionne pour les caption mais en théorie, cela devrait marcher ! TODO: à verifier pour Babel french.
  • XyMTeX possède le gros défaut de ne pas pouvoir faire de longues chaînes aliphatiques si l'on ne sait pas programmer le nombre de points entre deux structures. Le plus simple dans ce cas est donc l'emploi de Xfig (ou autre);
  • on ne peut pas imbriquer les formules, ce qui gêne considérablement son utilisation; en revanche, pour les cholestérols l'ensemble est très puissant !