Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- domaines_specialises:biologie:alignements_de_sequences [2020/07/14 20:39] – Ajout de référence biblio. jejust
+++ 4_domaines_specialises:biologie:alignements_de_sequences [2021/04/06 17:31] (Version actuelle) – Ajout d'un exemple compilé pour "pgfmolbio". jejust
@@ Ligne 15: / Ligne 15: @@
 les paramètres ''main_memory'' et ''stack_size'' dans le fichier ''texmf.cnf''.
-[[texdoc>tsfaq|Voir La FAQ spécifique de TeXshade.]]
+[[texdoc>tsfaq|Voir la FAQ spécifique de TeXshade.]]
 </note>
@@ Ligne 23: / Ligne 23: @@
 $\Reponse$  Le package [[ctanpkg>pgfmolbio]] propose de représenter:
   * des chromatogrammes (type séquençage Sanger),
-  * des domaines le long d'une séquence.
+  * des domaines le long d'une séquence:
+<WRAP column 60ex>
+<code latex>
+\documentclass{article}
+  \usepackage[domains]{pgfmolbio}
+  \usetikzlibrary{decorations.pathreplacing}
+\begin{document}
+\begin{pmbdomains}[name=Bidulase \TeX ique]{101}
+  \addfeature[description={\TeX}]{domain}{10}{25}
+  \addfeature[description={\LaTeX}]{domain}{40}{70}
+  \addfeature[description=Région 1]{range}{15}{30}
+  \addfeature[description=Région 2]{range}{25}{60}
+  \addfeature[description=Et la fin,%
+              style={very thick, draw=red},%
+              range font=\footnotesize\textcolor{red}]{range}{68}{86}
+\end{pmbdomains}
+\end{document}
+</code>
+</WRAP>
+<WRAP column 40ex>
+<latexdoc>
+\documentclass{article}
+  \usepackage[domains]{pgfmolbio}
+  \usetikzlibrary{decorations.pathreplacing}
+  \pagestyle{empty}
+\begin{document}
+\large
+\begin{pmbdomains}[name=Bidulase \TeX ique]{101}
+  \addfeature[description={\TeX}]{domain}{10}{25}
+  \addfeature[description={\LaTeX}]{domain}{40}{70}
+  \addfeature[description=Région 1]{range}{15}{30}
+  \addfeature[description=Région 2]{range}{25}{60}
+  \addfeature[description=Et la fin,%
+              style={very thick, draw=red},%
+              range font=\footnotesize\textcolor{red}]{range}{68}{86}
+\end{pmbdomains}
+\end{document}
+</latexdoc>
+</WRAP>
+<WRAP clear />
 $\Reponse$  Enfin, [[ctanpkg>textopo|TeXtopo]] permet de dessiner la structure secondaire